在區分重大責任事故與自然事故的時候，應當從以下兩個方面考察：

（1）是否存在違章行為，自然事故的引起往往與違章行為無關。在沒有違章行為的情況下可以排除重大責任事故。
（2）是否存在著主觀過失，自然事故的引起是超出人們的主觀意志的，屬於意外事件與不可抗力。在司法實踐上，造成了重大損害結果，並非都屬於重大責任事故，只有在排除自然事故的情況下，根據行為人的主觀與客觀情況，才能認定其行為是否構成重大責任事故罪。